Diese ganz spezielle Forschung hat als Forschungsgegenstand die Wissenschaft, welche auch mit wissenschaftlichen Methoden erforscht wird. Hierfür werden empirische Methoden verwendet und mathematische Modelle konzipiert, die helfen sollen, herauszufinden und zu erkennen wie Wissenschaft funktioniert, wie sie strukturiert ist und wie sie sich weiterentwickelt.
Dabei konzentriert sich die Wissenschaftsforschung auf die Ergebnisse der Wissenschaft, welche in wissenschaftlichen Publikationen, in Patenten und in der Arbeit berühmter Wissenschaftler ihren Ausdruck findet. Weiterhin zieht sie zu ihren Untersuchungen betriebswirtschaftliche Investitionsentscheidungen und anderes mit dem Wissenschaftsbetrieb zusammenhängenden mit in ihre Untersuchungen mit ein.
Die Wissenschaftsforschung hat jedoch nichts gemein mit der Wissenschaftstheorie, welche aus der Philosophie kommt und die erkenntnistheoretischen und wissenschaftsethischen Voraussetzungen und Konzepte wissenschaftlicher Arbeit untersucht.